WeMind följer landstingens vårdprogram för behandling av ångest, depression och andra psykiska diagnoser. Vårdprogrammen rekommenderar i de flesta fall kognitiv beteendeterapi (KBT) eftersom det är den terapi som har bäst bevisad effekt vid flertalet psykiska besvär. WeMind är Sveriges största enhet för KBT-terapi och vården ges enbart av legitimerade psykologer med utbildning i denna terapiform.
Terapin ser olika ut vid olika diagnoser och anpassas alltid till patientens behov och livssituation. Det gemensamma arbetet i terapin inleds med en kartläggning av hur besvären ser ut och utifrån den utformas en individuell plan för behandling. KBT är en tidsbegränsad behandling där patienten arbetar med hemuppgifter mellan varje session eftersom förändringar ofta behöver göras i praktiken, inte bara i samtal med psykologen. Mot slutet av terapin kan man glesa ut kontakten för att öva på att arbeta självständigt. Inför terapins avslutning skrivs en plan för hur man ska arbeta vidare med det man lärt sig. Syftet med KBT är att ta sig ur de svårigheter man hamnat i och lära sig principer så att man framöver själv kan hantera liknande problem.